Выбор предпрофильной образовательной траектории предполагается с шестого класса, когда ученики выбирают обучение в одной из образовательных вертикалей, обучение в которых возможно при успешном прохождении независимой диагностики МЦКО ДОНМ по математической и читательской грамотности.
По окончанию основного общего образования, образовательных вертикалей ученикам предоставляется возможность обучения на уровне среднего общего образования в классах предпрофессиональных проектов, таких как «Академический класс в московской школе», «Курчатовский класс» и «Космический класс» в рамках проекта «Инженерный класс в московской школе», «ИТ класс в московской школе» на основе требований к отбору в эти классы.